药占比过高，患者负担重，向来是公立医院改革的主要着眼点。9月18日，国家卫计委联合财政部发文表示，要严格控制医疗费用不合理增长，部分试点县的公立医院药占比(不含中药饮片)应下降到30%左右，县域内就诊率提高到90%左右。

根据国家卫计委官方网站消息，国务院办公厅曾于2015年发布了《关于全面推开县级公立医院综合改革的实施意见》，如今到2016年下半年，仍存在各地改革进展不平衡、可持续运行机制未完全建立的问题。

为此，国家卫计委和财政部表示，接下来全国所有县(市)要全部取消药品加成，实行以按病种付费为主、多种付费方式相结合的复合医保支付方式改革，实现医疗服务收入(不含药品、耗材和大型设备检查收入)占业务收入比重提升，患者自付医疗费用占总医疗费用比例下降。

除江苏省启东市、安徽省天长市等县级公立医院综合改革试点县，各省(区)也需选择3-5个县(市)作为示范县，推进“三医联动”改革。在一些试点县，公立医院药占比应下降到30%左右，百元医疗收入(不含药品收入)消耗的卫生材料费用下降到20元以下。

此外，根据国务院去年制定的县级公立医院综合改革试点方案，每个县(市)要办好1-2所县级公立医院，在此基础上探索公立医院转型重组，并放宽社会资本办医准入范围，在社会保险定点、重点专科建设、职称评定、医院评审等方面对非公立医疗机构和公立医疗机构实行同等对待政策。

对此，对外经济贸易大学中国经济发展研究中心研究员曹健告诉财新记者，政府对县级公立医院改革的整体思路仍然是以公立医院为主导，即便文件上支持社会资本举办医疗机构，最终县级医疗服务将仍被公立医院垄断。

“县级公立医院只要垄断，就还是没有竞争动力和活力。”曹健认为，县级公立医院的垄断地位不消除，即便降低药占比，强化监管机制，以药养医的问题还是没有办法从根本上解决，患者还是不得不为不必要的医疗支出埋单。

曹健还表示，政府现在保障患者基础医疗服务的办法，还是强调要拨给公立医院财政投入。但在世界上很多其他国家，政府提供基础医疗服务的手段其实已经转变成购买服务，即无论公立医院还是民营医院，只要提供了基础医疗服务，政府、医保都支付相应费用，这将有利于形成公平竞争的医疗服务市场。